Theo Quyết định số 56, việc bồi thường khi thu hồi đất chủ yếu thực hiện bằng tiền. Trong trường hợp người dân bị thu hồi toàn bộ đất ở, hoặc phần diện tích còn lại không đủ để tách thửa và không có nơi ở nào khác trong địa phương, họ sẽ được bồi thường bằng tiền, giao đất ở, hoặc mua nhà tái định cư.
Đối với đất nông nghiệp, mức bồi thường chi phí đầu tư còn lại được quy định là 50.000 đồng/m² đối với đất trồng lúa và 35.000 đồng/m² đối với đất trồng cây lâu năm. Mức bồi thường tối đa cho mỗi người sử dụng đất không vượt quá 250 triệu đồng. Đối với đất phi nông nghiệp, mức bồi thường là 35.000 đồng/m².
Nhà và các công trình xây dựng gắn liền với đất khi bị thu hồi sẽ được bồi thường theo giá trị hiện tại, tương đương 60% giá trị của công trình. Đối với các công trình không đạt tiêu chuẩn kỹ thuật, mức bồi thường sẽ được xác định sau khi các đơn vị liên quan thẩm định và lập hồ sơ thiết kế phù hợp.
Trường hợp di dời mồ mả, sẽ được bồi thường theo đơn giá do UBND thành phố quy định. Gia đình tự lo đất để di chuyển sẽ nhận thêm hỗ trợ 10 triệu đồng/mộ. Đối với các mộ vô chủ, các tổ chức sẽ ký hợp đồng với đơn vị chuyên trách để thực hiện di chuyển.
Người dân bị thu hồi đất phải di dời chỗ ở sẽ được hỗ trợ 10 triệu đồng/người nếu di chuyển trong phạm vi thành phố, và 15 triệu đồng/người nếu di chuyển sang tỉnh thành khác. Các tổ chức bị ảnh hưởng sẽ được hỗ trợ chi phí tháo dỡ và di chuyển tài sản theo dự toán được phê duyệt.
Để khuyến khích việc bàn giao mặt bằng đúng tiến độ, Điều 18 của Quyết định này quy định các mức thưởng cụ thể:
Quyết định này thể hiện nỗ lực của Hà Nội trong việc đảm bảo quy trình thu hồi đất diễn ra nhanh chóng, hiệu quả, đồng thời khuyến khích các tổ chức và cá nhân hợp tác, bàn giao mặt bằng đúng tiến độ.